RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 CRYBA4P53673 196 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 C16orf95Q9H693 158 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 BAALCQ8WXS3 180 aa8.99□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 CTRLP40313 264 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 TOMM6Q96B49 74 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 COX8AP10176 69 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.98□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 C10orf142B7Z368 130 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 IFITM1P13164 125 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 SYCNQ0VAF6 134 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 K7ERJ3 54 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.97□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 H0Y9J4 135 aa8.96□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.96□□□□□ -0.97
NEK1-201ENST00000439128 G3V4G9 280 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 CFC1BP0CG36 223 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 CFC1P0CG37 223 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 MIAQ16674 131 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 SIGMAR1Q99720 223 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 NPSP0C0P6 89 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 Q8N976 141 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 COX7BP24311 80 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 PROK1P58294 105 aa8.96□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 RS1O15537 224 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 H0YGX0 51 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 IGLC3P0DOY3 106 aa8.95□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 H7C423 109 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 PRM2P04554 102 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 LELP1Q5T871 98 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZPA2 131 aa8.94□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 P0C879 139 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 PCP2Q8IVA1 136 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 PYY3Q5JQD4 70 aa8.93□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 EP400Q96L91 3159 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 IGLV1-51P01701 117 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 NREPQ16612 68 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 FSHBP01225 129 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.92□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 EDN2P20800 178 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 UBE2D3P61077 147 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 C11orf86A6NJI1 115 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 FOXI1Q12951 378 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 C12orf74Q32Q52 190 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZTC4 211 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.91□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 RBX1P62877 108 aa8.9□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZVH6 145 aa8.9□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 A4D1N5 150 aa8.9□□□□□ -0.98
NEK1-201ENST00000439128 H3BQ85 93 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 C9orf118A6NHY6 69 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 LRP4O75096 1905 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 SORL1Q92673 2214 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.89□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 LINC01545Q5VT33 79 aa8.88□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.88□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 DCANP1Q8TF63 244 aa8.88□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 IGKV2D-28P01615 120 aa8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
NEK1-201ENST00000439128 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms