RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLURP1P55000 103 aa12.75□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SFTA2Q6UW10 78 aa12.75□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUX3Q96PT4 197 aa12.75□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 M0QXV9 152 aa12.74□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL11P62913 178 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VCYO14598 125 aa12.74□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AMELXQ99217 191 aa12.74□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SVIPQ8NHG7 77 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WFDC12Q8WWY7 111 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A1W2PRX2 142 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF688P0C7X2 276 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF876PQ49A33 203 aa12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIR2DL4Q99706 377 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM262E9PQX1 116 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EMP1P54849 157 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PROK1P58294 105 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB1P60022 68 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.71□□□□□ -0.37
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 J3QQQ9 107 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAX2Q96IS3 184 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.7□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLLNB2CW77 178 aa12.69□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERG28Q9UKR5 140 aa12.69□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 F6UB75 175 aa12.69□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.69□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.67□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PEMTQ9UBM1 199 aa12.67□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LEPROTO15243 131 aa12.67□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCANP1Q8TF63 244 aa12.67□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0B4J2C4 111 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCL24O00175 119 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-33P01772 117 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 P0DMU3 169 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM231AP0DMU4 169 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM231CP0DMU5 169 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM159AQ6UWV7 190 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JPT2Q9H910 190 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM223A0PJW6 202 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC25A20O43772 301 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC01600Q96MT4 127 aa12.66□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A4D1N5 150 aa12.65□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RHOHQ15669 191 aa12.65□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JMJD1CQ15652 2540 aa12.65□□□□□ -0.38
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.64□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CITED1Q99966 193 aa12.64□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MUC4Q99102 2169 aa12.64□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A087WWL8 130 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0J9YX75 114 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 F5H697 171 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ID1P41134 155 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRTAP10-3P60369 221 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF183Q96D59 192 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.63□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9JAW5 83 aa12.62□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf85Q96MD7 179 aa12.62□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 K7EQG2 157 aa12.62□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.61□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MDFICQ9P1T7 246 aa12.61□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SORL1Q92673 2214 aa12.61□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 M0QY20 66 aa12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 M0R2P5 195 aa12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RHODO00212 210 aa12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANAPC13Q9BS18 74 aa12.6□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATXN8Q156A1 80 aa12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV2A0A0B4J234 112 aa12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ODF3Q96PU9 254 aa12.59□□□□□ -0.39
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.58□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.57□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC01620Q4KN68 170 aa12.57□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.57□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.57□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8N1Y9 231 aa12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms