RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.94□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H2BAQ96A08 127 aa2.94□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.94□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPPP3Q9BW30 176 aa2.94□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNG13Q9P2W3 67 aa2.94□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.94□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAT1Q14517 4588 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MWV9 139 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 LTAP01374 205 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGPP08493 103 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00694P0DN24 101 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 GZMBP10144 247 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRIP1P50238 77 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP10-1P60331 282 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01620Q4KN68 170 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPWQ5EE01 88 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 LELP1Q5T871 98 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMUB2Q71RG4 321 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP82Q8N141 532 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL36BQ9NZH7 164 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.93□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBFOX3A6NFN3 312 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC11BP0C7V7 166 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q5VSD8 79 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 HERC1Q15751 4861 aa2.92□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0D9SG52 128 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMSDA8MTL9 139 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 UMAD1C9J7I0 102 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-DQA1P01909 254 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QBP02746 253 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNG4P50150 75 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL20P78556 96 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPV17L2Q567V2 206 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAGE2Q86Y30 109 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q8N814 137 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2WQ96B02 151 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 SFRP2Q96HF1 295 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP1S3Q96PC3 154 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEAL7Q9BRU2 100 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 MANBALQ9NQG1 85 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK12Q9UKR0 248 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WX48 190 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB19A4D1S5 217 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRPP02741 224 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM17P0DL12 118 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL2P10415 239 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEBPGP53567 150 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2D3P61077 147 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2D2P62837 147 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAGE3Q14657 143 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP14Q86UN6 197 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 NIT1Q86X76 327 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBD3L1Q8WWY6 194 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAALCQ8WXS3 180 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRZBQ92765 325 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTH2Q96A98 100 aa2.9□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNAI2O43623 268 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA1P01562 189 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 P01737 135 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT1A2P50226 295 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSCR10P59022 87 aa2.89□□□□□ -1.95
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNLZQ5SXM8 178 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms