RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.87□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 OSTCQ9NRP0 149 aa5.87□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 CEBPGP53567 150 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 TWIST1Q15672 202 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 TSKUQ8WUA8 353 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 RMI2Q96E14 147 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 NIT2Q9NQR4 276 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 C9JQL5 133 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 Q0VG73 95 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 MPV17L2Q567V2 206 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 Q8N814 137 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 ISOC2Q96AB3 205 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 KLK12Q9UKR0 248 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 V9GYV3 84 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 FAT1Q14517 4588 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1B0GUT8 65 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 HIGD1CA8MV81 97 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 PEA15Q15121 130 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 GATD1Q8NB37 220 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 PRR34Q9NV39 138 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 NAT8Q9UHE5 227 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00963-204ENST00000427778 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1B0GUV1 79 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 RBX1P62877 108 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 WFDC2Q14508 124 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 MIAQ16674 131 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 ENHOQ6UWT2 76 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 UBE2WQ96B02 151 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 BORCS7Q96B45 105 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM262E9PQX1 116 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 NCR2O95944 276 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 GCSHP23434 173 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 KRTAP10-1P60331 282 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 Q8N976 141 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM243Q9BU79 118 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.82□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 CRPP02741 224 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 COTL1Q14019 142 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 ADIRFQ15847 76 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 NUP35Q8NFH5 326 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 MRAP2Q96G30 205 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.81□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1B0GW15 77 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 H7C423 109 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 AMTP48728 403 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 XGP55808 180 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 GAGE6Q13070 117 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 RIGQ13278 110 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 Q5VSD8 79 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 RNF185Q96GF1 192 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 RAB4AP20338 218 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 RAB14P61106 215 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 C14orf177Q52M58 125 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 Q6ZSA8 131 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 BAALCQ8WXS3 180 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 I3L3M4 83 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 LECT2O14960 151 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 PPP1R17O96001 155 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 REG3AQ06141 175 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 CLLU1Q5K131 121 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1B0GXF2 115 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 UBE2L6O14933 153 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 GAS8-AS1O95177 125 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 TSHBP01222 138 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 APCSP02743 223 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 S100A8P05109 93 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 ESDP10768 282 aa5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
LINC00963-204ENST00000427778 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.8 ms