RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 9.1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 K7EQD1 137 aa13.4□□□□□ -0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.39□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS25Q9BRG1 176 aa13.38□□□□□ -0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.37□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOTCH3Q9UM47 2321 aa13.37□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAGE12IP0CL82 117 aa13.35□□□□□ -0.27
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.35□□□□□ -0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-30P01768 117 aa13.34□□□□□ -0.27
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