RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 MDFICQ9P1T7 246 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.71□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SORL1Q92673 2214 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TSTD3H0UI37 97 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 GNRH2O43555 120 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LEPROTL1O95214 131 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 KRTDAPP60985 99 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 PMCHL1Q16048 86 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 Q8N8P6 123 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.7□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 DNAH2Q9P225 4427 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LINC01549A6NIU2 74 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 A8MWV9 139 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SMKR1H3BMG3 65 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SCGB1D1O95968 90 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 MGPP08493 103 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C3orf79P0CE67 100 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SSTP61278 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 PKIAP61925 76 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SPXQ9BT56 116 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.69□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 A0A096LNJ9 63 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 H7C1H1 209 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 M0R2P5 195 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TCAPO15273 167 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 FXYD7P58549 80 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LINC00315P59091 139 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 PET117Q6UWS5 81 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 Q8N976 141 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C16orf74Q96GX8 76 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 VAMP8Q9BV40 100 aa4.68□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 G0S2P27469 103 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 FCER1GP30273 86 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LAGE3Q14657 143 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ZNF56Q15929 161 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ZNF876PQ49A33 203 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RASL10AQ92737 203 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LINC01587Q99440 93 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ATP5LO75964 103 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 GAS8-AS1O95177 125 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 CRYGDP07320 174 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 RHOHQ15669 191 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 LINC01545Q5VT33 79 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 ST20Q9HBF5 79 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 XCL2Q9UBD3 114 aa4.66□□□□□ -1.66
CCL20-202ENST00000409189 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 GAGE12JA6NER3 117 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 M0QY20 66 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 CIDEAO60543 219 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LY6G6CO95867 125 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 KIR2DL4Q99706 377 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.65□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WYN8 130 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 VCYO14598 125 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 RS1O15537 224 aa4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCL20-202ENST00000409189 DDTP30046 118 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.8 ms