RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365061.1

RNA5SP172-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 172, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP172, Length 118 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP172-201ENST00000365061 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 H0Y8G0 127 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 GYPEP15421 78 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 C12orf74Q32Q52 190 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PYY3Q5JQD4 70 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PET117Q6UWS5 81 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 Q6ZN92 141 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.96□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 A0A0J9YY99 117 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 LINC00694P0DN24 101 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 S100A12P80511 92 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 Q6ZTC4 211 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 ERASQ7Z444 233 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TMEM141Q96I45 108 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TIMM17AQ99595 171 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 C12orf57Q99622 126 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 Q9UF83 564 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 COL6A5A8TX70 2615 aa4.95□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 UBE2L6O14933 153 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PRSS1P07477 247 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 NPSP0C0P6 89 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 DNHD1Q96M86 4753 aa4.94□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 H3BNG1 76 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 H7C423 109 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 LINC01545Q5VT33 79 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TMEM243Q9BU79 118 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.93□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 IGIPA6NJ69 53 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 DEFA6Q01524 100 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 Q8N976 141 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 BAALCQ8WXS3 180 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TMEM101Q96IK0 257 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.92□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 A0A087WX48 190 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 A0A096LPF7 62 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 F8VRH5 84 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PLNP26678 52 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PKIAP61925 76 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 ODF1Q14990 250 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 PMVKQ15126 192 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 VAMP8Q9BV40 100 aa4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNA5SP172-201ENST00000365061 DPM2O94777 84 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 IGKCP01834 107 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 FGF6P10767 208 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 ATOH7Q8N100 152 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 VCX2Q9H322 139 aa4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 TIRAPP58753 221 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP172-201ENST00000365061 GAGE6Q13070 117 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 331.6 ms