RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PMCHP20382 165 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00310P59036 64 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 FA2HQ7L5A8 372 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DAD1P61803 113 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST3H2BBQ8N257 126 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N8P6 123 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC30Q96LL9 226 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM2Q9BVW6 85 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 AP5S1Q9NUS5 200 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMAT4Q9H898 229 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01546A6NGU7 62 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EMI3 77 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 HSBP1O75506 76 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A2P29034 98 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZSN1 163 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EQD1 137 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 CELA1Q9UNI1 258 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 NUPR1O60356 82 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 FHL2Q14192 279 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 B9D2Q9BPU9 175 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM70Q9BUB7 260 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHAF1A6NFY7 115 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 VCYO14598 125 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM18Q96B42 140 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5G1P05496 136 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOHQ15669 191 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A29Q8N8R3 303 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZD11Q5EBL8 140 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 TCAPO15273 167 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 P0DMU3 169 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM231AP0DMU4 169 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM231CP0DMU5 169 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL4Q99706 377 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 PRADC1Q9BSG0 188 aa21.92■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 AMTP48728 403 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 PRO0255Q9UI72 69 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 HHLA3Q9XRX5 114 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0J9YWU9 116 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 DNHD1Q96M86 4753 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 LAGE3Q14657 143 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 ORMDL2Q53FV1 153 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BLQ99880 126 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-206ENST00000588815 I3L3M4 83 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 IFITM10A6NMD0 228 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf74Q32Q52 190 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP4P15090 132 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM19A2Q8N3H0 131 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 G0S2P27469 103 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYBA4P53673 196 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNRF2Q8NHG8 242 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 TENM3Q9P273 2699 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 HBDP02042 147 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 Q9UF83 564 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 FCER1GP30273 86 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf45Q8TAV5 145 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFA6Q01524 100 aa21.83■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01549A6NIU2 74 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2D3P61077 147 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2D2P62837 147 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PMCHL1Q16048 86 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 NEGR1Q7Z3B1 354 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A096LNJ9 63 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE12JA6NER3 117 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 F5H768 121 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX4O43316 350 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE1Q13065 139 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE4Q13068 117 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE5Q13069 117 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE13Q4V321 117 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 LEPROTL1O95214 131 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDT3O95989 172 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 TSHBP01222 138 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00694P0DN24 101 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB8Q9UJY1 196 aa21.77■■□□□ 1.08
CAPNS1-206ENST00000588815 COTL1Q14019 142 aa21.77■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10D4PQ8NGN7 298 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GYPEP15421 78 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-206ENST00000588815 BTF3P20290 206 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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