RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	APC	P25054	2843 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	POLQ	O75417	2590 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	ITPR3	Q14573	2671 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	ZFHX3	Q15911	3703 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		C9JAW5	83 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	PRAC2	D3DTV9	90 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	VCY	O14598	125 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	IGHV1-69	P01742	117 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	HES1	Q14469	280 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	ZNF876P	Q49A33	203 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		Q8N6K4	173 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	NF1	P21359	2839 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		J3QQQ9	107 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		M0R1W7	72 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		M0R2P5	195 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	OVOL1	O14753	267 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	TIMM23	O14925	209 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	APELA	P0DMC3	54 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		Q6YL49	198 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	NRGN	Q92686	78 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	KIR2DL4	Q99706	377 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	SVIL	O95425	2214 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		H3BMM0	161 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329		H3BVH4	76 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	CCL21	O00585	134 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	TSHB	P01222	138 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	ARL3	P36405	182 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	RHOH	Q15669	191 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	CCL17	Q92583	94 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	UBE2W	Q96B02	151 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	FBN3	Q75N90	2809 aa		5.21	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		5.21	□□□□□ -1.57
USP7-217	ENST00000567329	CENPE	Q02224	2701 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329		A0A1B0GX51	115 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329		A4D1N5	150 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	ODF3B	A8MYP8	253 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	CRLF1	O75462	422 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	COX6C	P09669	75 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	LINC00315	P59091	139 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	FAM27E3	Q08E93	113 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	LINC01587	Q99440	93 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	SMR3A	Q99954	134 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329		A0A0J9YXY3	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TIMM17B	O60830	172 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	CXCL5	P42830	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	METTL26	Q96S19	204 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	BRI3	O95415	125 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	DLX1	P56177	255 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP7-217	ENST00000567329	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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