RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 I3L3M4 83 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 RIPPLY3P57055 190 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 Q6ZSN1 163 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 PRO1933Q9H354 126 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 RHOHQ15669 191 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 Q6ZTI0 123 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 X6R8D5 127 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 CUBNO60494 3623 aa7□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 PRSS1P07477 247 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 ERASQ7Z444 233 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 C18orf15Q96N68 181 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 ZMAT4Q9H898 229 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 A8MZ25 164 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TSHBP01222 138 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 DDTP30046 118 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 SPATA45Q537H7 98 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 ATOH7Q8N100 152 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 ZNF479Q96JC4 524 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 NF1P21359 2839 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 IGIPA6NJ69 53 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 LINC00587B1AMM8 73 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 H0Y8G0 127 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 P0DMU3 169 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 FAM231AP0DMU4 169 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 FAM231CP0DMU5 169 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 KRTAP10-11P60412 298 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 ODF1Q14990 250 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TMEM141Q96I45 108 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-209ENST00000547449 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 A0A087WX48 190 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE12BA1L429 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE7O76087 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE12FP0CL80 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE12GP0CL81 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 GAGE12IP0CL82 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 IGLC3P0DOY3 106 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 MAJINQ3KP22 176 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 Q6ZN92 141 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 RNF183Q96D59 192 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 TIMM17AQ99595 171 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 JMJD1CQ15652 2540 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 LYRM9A8MSI8 78 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 K7EQD1 137 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 FHL2Q14192 279 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DKK2Q9UBU2 259 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 Q9UF83 564 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 hDV102S1A0JD36 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DPM2O94777 84 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 NPSP0C0P6 89 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 MIFP14174 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 OR11H2Q8NH07 326 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 BAALCQ8WXS3 180 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 IGKCP01834 107 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 EMP1P54849 157 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 UBE2D3P61077 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 UBE2D2P62837 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 COTL1Q14019 142 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DEFB135Q30KP9 77 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-209ENST00000547449 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms