RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NRAC	Q8N912	160 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WYN8	130 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R036	132 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PRY	O14603	147 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2D3	P61077	147 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2D2	P62837	147 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	EPDR1	Q9UM22	224 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB11	Q9Y547	144 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PHOX2A	O14813	284 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CHTF8	P0CG12	524 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GTSF1	Q8WW33	167 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SFRP2	Q96HF1	295 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01600	Q96MT4	127 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA7	P01567	189 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PET100	P0DJ07	73 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF56	Q15929	161 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GCHFR	P30047	84 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE6	Q13070	117 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR73	Q6P4I2	378 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SKAP2-209	ENST00000497511	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RBX1	P62877	108 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	REG3G	Q6UW15	175 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YXV3	536 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB4B	P61018	213 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR34	Q9NV39	138 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D1A	O60880	128 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MPC2	O95563	127 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf1	O96002	111 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB5C	P51148	216 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	REG3A	Q06141	175 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MAJIN	Q3KP22	176 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511		Q86TA4	180 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ENKUR	Q8TC29	256 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	DERL1	Q9BUN8	251 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC1	Q9HC57	220 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		6.81	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX7	O00628	323 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	6.8	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SSNA1	O43805	119 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511		P01737	135 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MB	P02144	154 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2G2	P60604	165 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2G1	P62253	170 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	COX6A2	Q02221	97 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SUN5	Q8TC36	379 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.79	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PRE2	83 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CRIP1	P50238	77 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	H2BFS	P57053	126 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	STPG4	Q8N801	248 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.78	□□□□□ -1.32
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM17	P0DL12	118 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	GZMB	P10144	247 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1A2	P50226	295 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFA3	P59666	94 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-8	P60410	259 aa		6.77	□□□□□ -1.33

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