RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.43□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.43□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC140Q96MF4 163 aa9.43□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.43□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PROK1P58294 105 aa9.43□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF185Q96GF1 192 aa9.43□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 FOXI1Q12951 378 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZS46 218 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PIP4P1Q86T03 277 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF183Q96D59 192 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 C20orf173Q96LM9 149 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF223E7ERA6 249 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8N1Y9 231 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ESM1Q9NQ30 184 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PRSS47A8MTI9 375 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 TCL1BO95988 128 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.42□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CARD19Q96LW7 228 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 STHQ8IWL8 128 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 RASL10AQ92737 203 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 SIVA1O15304 175 aa9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CFC1BP0CG36 223 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CFC1P0CG37 223 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLC6P0CF74 106 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ATXN8Q156A1 80 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZSV7 163 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 FLNCQ14315 2725 aa9.4□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF580Q9UK33 172 aa9.4□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.4□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1-69P01742 117 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 K7ENP7 123 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01559Q495D7 138 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 H3BMM0 161 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2WQ96B02 151 aa9.39□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 CITED1Q99966 193 aa9.38□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.38□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 SLURP1P55000 103 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE7O76087 117 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE12FP0CL80 117 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE12GP0CL81 117 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE12IP0CL82 117 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 Q9H8V8 135 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 FSTL3O95633 263 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE6Q13070 117 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.37□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 E9PLD3 99 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM101Q96IK0 257 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 PRO3102Q9H379 93 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 I3L3M4 83 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 TEN1Q86WV5 123 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYGBP07316 175 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.36□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 OOSP1A8MZH6 123 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 UCNP55089 124 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 C5orf38Q86SI9 138 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 NPBQ8NG41 125 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 Q9HAA7 133 aa9.35□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 XGP55808 180 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF415Q09FC8 603 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 MSMBP08118 114 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 COX6B1P14854 86 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 COL4A2P08572 1712 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFA4O00483 81 aa9.34□□□□□ -0.91
TRIOBP-211ENST00000492485 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZUT4 128 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM223BA6NKX1 122 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 IFITM1P13164 125 aa9.33□□□□□ -0.92
TRIOBP-211ENST00000492485 ZANQ9Y493 2812 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms