RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PSCAO43653 123 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 S100A8P05109 93 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PKIAP61925 76 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 ELOBQ15370 118 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 UQCC3Q6UW78 93 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 GTSF1Q8WW33 167 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 F8W036 122 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 UBE2D3P61077 147 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 UBE2D2P62837 147 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 NIT2Q9NQR4 276 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 V9GYV3 84 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 A0A1B0GW15 77 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 UBE2L6O14933 153 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 COMMD7Q86VX2 200 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 CNFNQ9BYD5 112 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 Q9HAA7 133 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 Q9UF83 564 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 M0QY20 66 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PPP1R17O96001 155 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PMCHP20382 165 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 CAMPP49913 170 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 LINC00315P59091 139 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 COTL1Q14019 142 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 NUP35Q8NFH5 326 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 FRZBQ92765 325 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 RMI2Q96E14 147 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 TM2D2Q9BX73 214 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 RTL8CO15255 209 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 IFITM2Q01629 132 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 ST20Q9HBF5 79 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 RYR2Q92736 4967 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 TMEM218A2RU14 115 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 CRPP02741 224 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 AMTP48728 403 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 GATD1Q8NB37 220 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 MRAP2Q96G30 205 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 TMEM243Q9BU79 118 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 RYR3Q15413 4870 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 KMT2AQ03164 3969 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 LINC00694P0DN24 101 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 S100PP25815 95 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 CKS2P33552 79 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 HBBP68871 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 GAGE6Q13070 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 NDUFA5Q16718 116 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 KLK12Q9UKR0 248 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 COX11Q9Y6N1 276 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 I3L3M4 83 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 RAB4AP20338 218 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 FCER1GP30273 86 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 TNP2Q05952 138 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 Q0VG73 95 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 NIT1Q86X76 327 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 AMN1Q8IY45 258 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 UBE2WQ96B02 151 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 SEC11CQ9BY50 192 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 APCSP02743 223 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 LAGE3Q14657 143 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 BTF3L4Q96K17 158 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 LINC00862A6NCI5 91 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 VCYO14598 125 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 NCR2O95944 276 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 IQCJQ1A5X6 159 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-208ENST00000462335 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.2 ms