RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q0VG73	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PARL	Q9H300	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EQG2	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD7	P09564	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5G3	P48201	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB131A	P59861	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	NF1	P21359	2839 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BRM9	83 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		H7C1H1	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5G1	P05496	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		P0DMU3	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMB3	P49720	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCRQ	O14949	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRIAP1	O43715	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PYY	P10082	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSN1S1	P47710	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ELOB	Q15370	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EIL1	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF253	O75346	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FABP2	P12104	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	GCHFR	P30047	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	NMU	P48645	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDE6H	Q13956	83 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZRU5	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PGP	A6NDG6	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SOCS3	O14543	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNCG	O76070	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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