RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf195Q5TG92 126 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB8BQ92930 207 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCAPD3P42695 1498 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFAIP8O95379 198 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8GP07360 202 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CARD18P57730 90 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAMP3Q15836 100 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFXN4Q6P4A7 337 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCIMPQ6UWF3 145 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT20Q8IY31 132 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 MORN4Q8NDC4 146 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENPP5Q9UJA9 477 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 R4GMQ9 66 aa-3.47□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB19A4D1S5 217 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPGDSO60760 199 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTRP02766 147 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYL12AP19105 171 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFYBP25208 207 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00523Q86TU6 105 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 FKBP11Q9NYL4 201 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP350Q5VT06 3117 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC37A3O60309 1634 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GW15 77 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM238C9JI98 176 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 CST2P09228 141 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYT1P21579 422 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCAP31P51572 246 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 HBBP68871 147 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSMO1Q15800 293 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6AWC8 147 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZUT4 128 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00846Q9NV44 126 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLTPQ9NZD2 209 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV4A0A0B4J268 109 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 WRBO00258 174 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MGPP08493 103 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2D1P51668 147 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLVS2Q5SYC1 327 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A26Q70HW3 274 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51D1Q8NGF3 324 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKIGQ9Y2B9 76 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH7P12883 1935 aa-3.5□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM223BA6NKX1 122 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN24A6NM45 220 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCG22E2RYF7 251 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-3.51□□□□□ -2.97
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RNU6-172P-201ENST00000411000 COX16Q9P0S2 106 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-3.51□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3C2AO00443 1686 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-3.52□□□□□ -2.97
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RNU6-172P-201ENST00000411000 INSL3P51460 131 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAXP61244 160 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM19Q96E16 107 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 UFC1Q9Y3C8 167 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD50Q92878 1312 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 DISP2A7MBM2 1401 aa-3.53□□□□□ -2.97
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CKS2P33552 79 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 OMPP47874 163 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 B2MP61769 119 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLCAPP62952 87 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 STK38Q15208 465 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 PP6455Q8WZ26 134 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 STOML2Q9UJZ1 356 aa-3.53□□□□□ -2.97
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R17O96001 155 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM236CP0DP71 79 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf113Q5VZT2 155 aa-3.54□□□□□ -2.98
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