RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 E9PLD3 99 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 CITED1Q99966 193 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB135Q30KP9 77 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 FSTL3O95633 263 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 MDFICQ9P1T7 246 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC140Q96MF4 163 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 ACYP1P07311 99 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 PLXNB1O43157 2135 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZPA2 131 aa15.46■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.46■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.46■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB105AQ8NG35 78 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 MED12LQ86YW9 2145 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA1O15239 70 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf86A6NJI1 115 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD2P54710 66 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 IGF1P05019 195 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL5P42830 114 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 ODF1Q14990 250 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 PRO0255Q9UI72 69 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01548A6NM66 108 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 PRO3102Q9H379 93 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01620Q4KN68 170 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GXF2 115 aa15.41■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 PRORYQ9H606 182 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 TIRAPP58753 221 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG11BQ08648 103 aa15.4■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.06
CCSAP-203ENST00000366687 DAND5Q8N907 189 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf84I3L1E1 186 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 KLK12Q9UKR0 248 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB4AO15263 64 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 RS1O15537 224 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRACP01848 142 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.39■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 F8W735 103 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV2-8P01709 118 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 TEN1Q86WV5 123 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 ODF3Q96PU9 254 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 TM2D2Q9BX73 214 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LTBP2Q14767 1821 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 MLST8Q9BVC4 326 aa15.38■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 H3BQ85 93 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 EBI3Q14213 229 aa15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 K7EQG2 157 aa15.36■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS9O00182 355 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 DSCAMO60469 2012 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 IGLC6P0CF74 106 aa15.35■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 Q6YL49 198 aa15.34■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.34■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 CRYGBP07316 175 aa15.33■□□□□ 0.05
CCSAP-203ENST00000366687 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.33■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.32■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa15.32■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 LECT2O14960 151 aa15.32■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM131Q92545 1883 aa15.31■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 TAX1BP3O14907 124 aa15.31■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFS5O43920 106 aa15.31■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC2Q14508 124 aa15.31■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 OBSL1O75147 1896 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 LY6LH3BQJ8 138 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZUT4 128 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 H3BT86 120 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZTI0 123 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0B4J2C4 111 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.3■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 SPANXCQ9NY87 97 aa15.29■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 MBD6Q96DN6 1003 aa15.29■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 DIRC1Q969H9 104 aa15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 NREPQ16612 68 aa15.28■□□□□ 0.04
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms