RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYGBP07316 175 aa12.42□□□□□ -0.42
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SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
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SH3BP4-201ENST00000344528 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.4□□□□□ -0.42
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV2-8P01709 118 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 IGLC6P0CF74 106 aa12.32□□□□□ -0.44
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SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZTI0 123 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 HIGD1BQ9P298 99 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8N6K4 173 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.31□□□□□ -0.44
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SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 LY6G6DO95868 133 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF702PQ9H963 129 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.454e-7■■■■□ 23.7
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 CITED1Q99966 193 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 C20orf173Q96LM9 149 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf99Q6UWK7 81 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 PLXNB1O43157 2135 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRG1Q3Y452 100 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.25□□□□□ -0.45
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