RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 A4D1N5 150 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 P0DMU3 169 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 FAM231AP0DMU4 169 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 FAM231CP0DMU5 169 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TMEM141Q96I45 108 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ZMAT4Q9H898 229 aa3.57□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PRM2P04554 102 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 RNF223E7ERA6 249 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 I3L3M4 83 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 SNCGO76070 127 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TSPAN13O95857 204 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 XCL2Q9UBD3 114 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 U3KQE9 123 aa3.56□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 SLC25A20O43772 301 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 COX6B1P14854 86 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 FOXI1Q12951 378 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PIFOQ8TCI5 191 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ACANP16112 2415 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 A0A087WW49 117 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 A0A0J9YY99 117 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 A6NDX4 124 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 M0R2P5 195 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 SLURP1P55000 103 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TTC32Q5I0X7 151 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 GPHB5Q86YW7 130 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TEX29Q8N6K0 151 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 DAND5Q8N907 189 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.55□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 H3BUA1 57 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TCL1BO95988 128 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PROK1P58294 105 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 C2orf82Q6UX34 121 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ATP6V0BQ99437 205 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 A0A0J9YX75 114 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 AVPP01185 164 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 CFC1BP0CG36 223 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 CFC1P0CG37 223 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 C19orf54Q5BKX5 351 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TIMM17AQ99595 171 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 UBE2L6O14933 153 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 MED14OSP0DP75 135 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ZNF415Q09FC8 603 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 STHQ8IWL8 128 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 CFHR3Q02985 330 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 GAGE2BQ13066 116 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ATXN8Q156A1 80 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 GAGE2EQ4V326 116 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TEN1Q86WV5 123 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.54□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 A8MZ25 164 aa3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TMEM262E9PQX1 116 aa3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 RHOHQ15669 191 aa3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ZNF575Q86XF7 245 aa3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 PEMTQ9UBM1 199 aa3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
USP44-201ENST00000258499 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.6 ms