RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.72□□□□□ -0.21
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HOXD11-201ENST00000249504 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.71□□□□□ -0.21
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HOXD11-201ENST00000249504 AKR1D1P51857 326 aa13.64□□□□□ -0.23
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HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.64□□□□□ -0.23
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HOXD11-201ENST00000249504 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.63□□□□□ -0.23
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HOXD11-201ENST00000249504 NRACQ8N912 160 aa13.62□□□□□ -0.23
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HOXD11-201ENST00000249504 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.6□□□□□ -0.23
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HOXD11-201ENST00000249504 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM2Q9BVW6 85 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 NIT2Q9NQR4 276 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 K7EMI3 77 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.53□□□□□ -0.24
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