RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	AP1S3	Q96PC3	154 aa		15.57	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	S100A8	P05109	93 aa		15.56	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	RS1	O15537	224 aa		15.55	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		15.55	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		15.55	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		15.54	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	SMIM17	P0DL12	118 aa		15.54	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	HBB	P68871	147 aa		15.54	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CASC10	Q5T4H9	136 aa		15.54	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	C18orf15	Q96N68	181 aa		15.54	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	NUPR2	A6NF83	97 aa		15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	JPT2	Q9H910	190 aa		15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	NACA	E9PAV3	2078 aa		15.52	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CIDEA	O60543	219 aa		15.52	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CAMP	P49913	170 aa		15.52	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	ELOB	Q15370	118 aa		15.52	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
LTBP4-227	ENST00000600026	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		15.51	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A1B0GXF2	115 aa		15.51	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	RHOD	O00212	210 aa		15.51	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	ATP5G1	P05496	136 aa		15.51	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		15.51	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A087WWL8	130 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3-53	P01767	116 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	HTN3	P15516	51 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	RASL11A	Q6T310	242 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		15.5	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	SCO1	O75880	301 aa		15.49	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	EVI2A	P22794	236 aa		15.49	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	COX19	Q49B96	90 aa		15.49	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		15.49	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF479	Q96JC4	524 aa		15.49	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		15.48	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		15.48	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	CRYGD	P07320	174 aa		15.48	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		15.48	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	RAB4B	P61018	213 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		15.47	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	RYR2	Q92736	4967 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	MGP	P08493	103 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF56	Q15929	161 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	GATD1	Q8NB37	220 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM210B	Q96KR6	192 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026	YPEL4	Q96NS1	127 aa		15.46	■□□□□ 0.07
LTBP4-227	ENST00000600026		F5H697	171 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		15.45	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026		F5H768	121 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	SLA	Q13239	276 aa		15.44	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	FHL2	Q14192	279 aa		15.43	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		15.43	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		15.43	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	IGLL5	B9A064	214 aa		15.42	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	HLA-DQA1	P01909	254 aa		15.42	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	HOXA5	P20719	270 aa		15.42	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00315	P59091	139 aa		15.42	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		15.42	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	AMN1	Q8IY45	258 aa		15.42	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	MT-ND6	P03923	174 aa		15.41	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		15.41	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	RAB4A	P20338	218 aa		15.4	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	FRZB	Q92765	325 aa		15.4	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	PRO0255	Q9UI72	69 aa		15.4	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		15.4	■□□□□ 0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		15.39	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026		H7C1H1	209 aa		15.39	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	RNF185	Q96GF1	192 aa		15.39	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	COLCA2	A8K830	154 aa		15.38	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026		K7EQD1	137 aa		15.38	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		15.38	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	MRAP2	Q96G30	205 aa		15.38	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		15.38	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	PAX4	O43316	350 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	APCS	P02743	223 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	CRYBA4	P53673	196 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	RHOH	Q15669	191 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6ZSN1	163 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	APLN	Q9ULZ1	77 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	TCTA	P57738	103 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	LYST	Q99698	3801 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	CKS2	P33552	79 aa		15.35	■□□□□ 0.05

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