RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 B4DSR2 109 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 G3V318 75 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BUX3 64 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R3E3 92 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 BRI3O95415 125 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TRGV3P03979 118 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 APOC4P55056 127 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFA6Q01524 100 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 Q1RN00 199 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NAGKQ9UJ70 344 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 WNK2Q9Y3S1 2297 aa3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GUT8 65 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM189A5PLL7 270 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 RBAKDNA6NC62 111 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NDX4 124 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 F2Z2F3 143 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QLI3 93 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFA4O00483 81 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NUPR1O60356 82 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV3-20P01619 116 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHG2P01859 326 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 GPX1P07203 203 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF224P0DH78 156 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB4AP20338 218 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 DDTP30046 118 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CTAG1AP78358 180 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0087Q14695 138 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 LY6EQ16553 131 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 C14orf177Q52M58 125 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 LCN12Q6JVE5 192 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 GATD1Q8NB37 220 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 C18orf32Q8TCD1 76 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 USMG5Q96IX5 58 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 Q9UF83 564 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 V9GYY9 64 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ATRQ13535 2644 aa3□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A8MWP6 167 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R2Z0 102 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 SH2D1AO60880 128 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CRLF1O75462 422 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 NTF3P20783 257 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTDAPP60985 99 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 COTL1Q14019 142 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 GDF5OSQ5U4N7 250 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 PIFOQ8TCI5 191 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf33Q8WU49 177 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 VAMP8Q9BV40 100 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 PRO1933Q9H354 126 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 MDFICQ9P1T7 246 aa2.99□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CR1P17927 2039 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 PDZD2O15018 2839 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 HIVEP1P15822 2718 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A096LNT2 108 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0J9YXY3 114 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 C20orf202A1L168 122 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CHTF8P0CG12 524 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DMBP28068 263 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CTRLP40313 264 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 CRIP1P50238 77 aa2.98□□□□□ -1.93
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF138P52744 262 aa2.98□□□□□ -1.93
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