RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 NOTCH1P46531 2555 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MRAP2Q96G30 205 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CKS2P33552 79 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10J3Q5JRS4 329 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EIL1 84 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A6P06703 90 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 JPT2Q9H910 190 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYGDP07320 174 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 D6R8Y8 96 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RHODO00212 210 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00315P59091 139 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 Q0VG73 95 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PRELID3AQ96N28 172 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WWL8 130 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 RS1O15537 224 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 MGPP08493 103 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CIDEAO60543 219 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM74A4Q5TZK3 123 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP126Q5VTH2 177 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 C18orf32Q8TCD1 76 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R17O96001 155 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA6P56556 154 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP2Q6ZN57 461 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZTI0 123 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD10Q9BYL1 202 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 LYRM9A8MSI8 78 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8NAQ8 132 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 UFSP1Q6NVU6 142 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV4A0A0B4J268 109 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00612Q8N6U2 182 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 EDA2RQ9HAV5 297 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 F5H697 171 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF56Q15929 161 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 C18orf15Q96N68 181 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C5Q8NGB2 326 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SMKR1H3BMG3 65 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NCR2O95944 276 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 EMP1P54849 157 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB121Q5J5C9 76 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 BAGE3Q86Y29 109 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C1H1 209 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf52A6NGY3 159 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF6BO95407 300 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NPYP01303 97 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SUMO4Q6EEV6 95 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV2A0A075B6R0 118 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE12BA1L429 117 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE7O76087 117 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE12FP0CL80 117 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE12GP0CL81 117 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE12IP0CL82 117 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NRACQ8N912 160 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS47A8MTI9 375 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA25Q9BR10 227 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP1LC3AQ9H492 121 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SBSPONQ8IVN8 264 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DKK2Q9UBU2 259 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM222AQ5U5X8 452 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf78Q9BR46 151 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 M0QY20 66 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS8-AS1O95177 125 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-53P01767 116 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA5P20719 270 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCJQ1A5X6 159 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TM2D3Q9BRN9 247 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ESDP10768 282 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF479Q96JC4 524 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SPART-AS1P0CW21 52 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RETNQ9HD89 108 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SERF1AO75920 110 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NIT2Q9NQR4 276 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL32P62910 135 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 NIT1Q86X76 327 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00614P0C842 121 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB130BP0DP73 79 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB130AP0DP74 79 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 MRAPQ8TCY5 172 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB4AO15263 64 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-206ENST00000588815 ST20Q9HBF5 79 aa22.05■■□□□ 1.12
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