RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	GAGE5	Q13069	117 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RNPS1-222	ENST00000567147	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RNPS1-222	ENST00000567147	LELP1	Q5T871	98 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RNPS1-222	ENST00000567147		Q9UF83	564 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RNPS1-222	ENST00000567147	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RNPS1-222	ENST00000567147	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	CCL20	P78556	96 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A087WWL8	130 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147		M0R381	172 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	RHOD	O00212	210 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-33	P01772	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	FRZB	Q92765	325 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB5C	P51148	216 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	PSCA	O43653	123 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147		Q8N3U1	123 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147		Q9HAA7	133 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A087WWC5	75 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	SULT1A2	P50226	295 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	CXCL1	P09341	107 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	HAMP	P81172	84 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147		Q6ZNX1	250 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	SNAI2	O43623	268 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	C1QB	P02746	253 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	SST	P61278	116 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	OR5AL1	P0C617	328 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB4B	P61018	213 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	LAGE3	Q14657	143 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147		J3QL48	77 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	PDE6D	O43924	150 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	GCSH	P23434	173 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE2D3	P61077	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE2D2	P62837	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147		F5H697	171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	IFNA1	P01562	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	GNG4	P50150	75 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF56	Q15929	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	NIT1	Q86X76	327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	GZMB	P10144	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	BCL2	P10415	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147		Q8N814	137 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	AKAP14	Q86UN6	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RNPS1-222	ENST00000567147	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 266.6 ms