RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 CT45A10P0DMU9 189 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 IGLC2P0DOY2 106 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 XGP55808 180 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF415Q09FC8 603 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PMVKQ15126 192 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ELOBQ15370 118 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 DEFB125Q8N687 156 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C3orf56Q8N813 242 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM101Q96IK0 257 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 EPDR1Q9UM22 224 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 F8P00451 2351 aa3.08□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PLXNB1O43157 2135 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF727A8MUV8 499 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 GGTLC3B5MD39 225 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C9JQL5 133 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 J3KT08 172 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ISLRO14498 428 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 OVOL1O14753 267 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 NDUFB4O95168 129 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TRGC2P03986 189 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PRSS1P07477 247 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CFC1BP0CG36 223 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CFC1P0CG37 223 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 IGLC3P0DOY3 106 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ATP5G3P48201 142 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 UBE2G1P62253 170 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TAL2Q16559 108 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 LCE1FQ5T754 118 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SGK494Q96LW2 274 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C17orf77Q96MU5 243 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 Q9H3A6 140 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 NRN1Q9NPD7 142 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.07□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PEX7O00628 323 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TCRAP04437 139 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CSN3P07498 182 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 NF1P21359 2839 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TSPOP30536 169 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 INSL3P51460 131 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 KRTAP10-3P60369 221 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C4orf26Q17RF5 130 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 LCN12Q6JVE5 192 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 BAGE2Q86Y30 109 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 GATD1Q8NB37 220 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C11orf52Q96A22 123 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 FMC1Q96HJ9 113 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 VAMP8Q9BV40 100 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PARLQ9H300 379 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.06□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 JMJD1CQ15652 2540 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 RBAKDNA6NC62 111 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C9JAW5 83 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 C9JCJ5 164 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 K7EP34 96 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 M0R3E3 92 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 CXCL1P09341 107 aa3.05□□□□□ -1.92
FOXN3-210ENST00000555658 SPINK8P0C7L1 97 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms