RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	RAB14	P61106	215 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	JPT2	Q9H910	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		M0R2P5	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		M0R381	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	PAX4	O43316	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	NXPH4	O95158	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		Q6ZSN1	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		P01737	135 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	EVI2A	P22794	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	PEA15	Q15121	130 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ADIRF	Q15847	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	PKD1	P98161	4303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	RYR1	P21817	5038 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		A0A087WWL8	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SPX	Q9BT56	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	HSPG2	P98160	4391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	CRYBA4	P53673	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FHL2	Q14192	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	RASL10A	Q92737	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	RS1	O15537	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	MGP	P08493	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SRI	P30626	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		Q9UF83	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688		K7EQD1	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	PSCA	O43653	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CS-233	ENST00000552688	CRYGD	P07320	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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