RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 PDE6DO43924 150 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 EVI2AP22794 236 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 GAGE1Q13065 139 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 GAGE4Q13068 117 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 GAGE5Q13069 117 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 GAGE13Q4V321 117 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 OR10AG1Q8NH19 301 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 GTSF1LQ9H1H1 148 aa12□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.99□□□□□ -0.49
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CS-219ENST00000550655 SMIM12Q96EX1 92 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.98□□□□□ -0.49
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CS-219ENST00000550655 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 KRTAP10-2P60368 255 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.97□□□□□ -0.49
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CS-219ENST00000550655 MED9Q9NWA0 146 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-219ENST00000550655 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.95□□□□□ -0.5
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CS-219ENST00000550655 GZMBP10144 247 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.93□□□□□ -0.5
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CS-219ENST00000550655 BLOC1S1P78537 153 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 Q8N3U1 123 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.93□□□□□ -0.5
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CS-219ENST00000550655 IGHV3-33P01772 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 ERVFC1-1P60608 527 aa11.92□□□□□ -0.5
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CS-219ENST00000550655 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 ZNF56Q15929 161 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.91□□□□□ -0.5
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CS-219ENST00000550655 A0A087WTM6 91 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 A0A087WWC5 75 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 K7EN84 100 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 P01737 135 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 UBE2D3P61077 147 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 SSTP61278 116 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 UBE2D2P62837 147 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 AP1S3Q96PC3 154 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-219ENST00000550655 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 TMEM250H0YL14 139 aa11.89□□□□□ -0.51
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CS-219ENST00000550655 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 TPPP3Q9BW30 176 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 BIN3Q9NQY0 253 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 RYR1P21817 5038 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 LAGE3Q14657 143 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 NUDT11Q96G61 164 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 Q9HAA7 133 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 XKRY2A2RUG3 117 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 CDK2AP2O75956 126 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 OCC1Q8TAD7 63 aa11.87□□□□□ -0.51
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CS-219ENST00000550655 EREGO14944 169 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 CTRLP40313 264 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 CACNG7P62955 275 aa11.86□□□□□ -0.51
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CS-219ENST00000550655 NIT1Q86X76 327 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 F2Z2F3 143 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 SMIM17P0DL12 118 aa11.85□□□□□ -0.51
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CS-219ENST00000550655 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 F5H697 171 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-219ENST00000550655 FAM210AQ96ND0 272 aa11.84□□□□□ -0.51
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