RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL1P09341 107 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB5CP51148 216 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP82Q8N141 532 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q8N1X5 172 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 M0R381 172 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3-30P01768 117 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3-33P01772 117 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAGE3Q14657 143 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q9UF83 564 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSCAO43653 123 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MANBALQ9NQG1 85 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WWL8 130 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX46H3BTG2 121 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCL20P78556 96 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNAI2O43623 268 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOR2AQ5JU69 321 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf52Q96A22 123 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM2D2Q9BX73 214 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q9HAA7 133 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNG13Q9P2W3 67 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5AL1P0C617 328 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SULT1A2P50226 295 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB4BP61018 213 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCSHP23434 173 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XGP55808 180 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP10-1P60331 282 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR27Q6MZM9 219 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC51BQ86UW2 128 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1QBP02746 253 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2D3P61077 147 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2D2P62837 147 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NIT1Q86X76 327 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q8N3U1 123 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q8N814 137 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM12Q96EX1 92 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DERL1Q9BUN8 251 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COX11Q9Y6N1 276 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE6DO43924 150 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNA1P01562 189 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLV2-8P01709 118 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF56Q15929 161 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CENPWQ5EE01 88 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZNX1 250 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELOBQ15370 118 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WX48 190 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNG4P50150 75 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RMI2Q96E14 147 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BIN3Q9NQY0 253 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MED9Q9NWA0 146 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB19A4D1S5 217 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPM2AB3EWF7 344 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F5H697 171 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGLC6P0CF74 106 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM17P0DL12 118 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL2P10415 239 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VAX2Q9UIW0 290 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XKRY2A2RUG3 117 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AP1S3Q96PC3 154 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms