RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-215ENST00000510074 B4DEV8 164 aa10.15□□□□□ -0.78
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SH3BP2-215ENST00000510074 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-215ENST00000510074 RPL12P30050 165 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
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SH3BP2-215ENST00000510074 STAG3L3P0CL85 134 aa10.12□□□□□ -0.79
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SH3BP2-215ENST00000510074 SUN5Q8TC36 379 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC32Q9BV29 185 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.1□□□□□ -0.79
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SH3BP2-215ENST00000510074 IFNA7P01567 189 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 H2BFSP57053 126 aa10.09□□□□□ -0.79
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SH3BP2-215ENST00000510074 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 CXorf1O96002 111 aa10.08□□□□□ -0.8
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SH3BP2-215ENST00000510074 CHTF8P0CG12 524 aa10.05□□□□□ -0.8
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SH3BP2-215ENST00000510074 REG3AQ06141 175 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.02□□□□□ -0.81
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SH3BP2-215ENST00000510074 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.02□□□□□ -0.81
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