RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 RIGQ13278 110 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 GTSF1Q8WW33 167 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 C9orf85Q96MD7 179 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 LYRM9A8MSI8 78 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 M0R381 172 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 GNRH2O43555 120 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 EMP1P54849 157 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 WDR73Q6P4I2 378 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 RASL11AQ6T310 242 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 Q8NAQ8 132 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 NUP35Q8NFH5 326 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 PTH2Q96A98 100 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 CNFNQ9BYD5 112 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 RETNQ9HD89 108 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 NXPH4O95158 308 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM17P0DL12 118 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 HBBP68871 147 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 TWIST1Q15672 202 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF876PQ49A33 203 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 COX19Q49B96 90 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 MDFICQ9P1T7 246 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 A8MWV9 139 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 RHODO00212 210 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 NPSP0C0P6 89 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 AZU1P20160 251 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.96□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 CIDEAO60543 219 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 SPINK4O60575 86 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MT-ND6P03923 174 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 RASL10AQ92737 203 aa6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 NTF3P20783 257 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 RAB4BP61018 213 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 DAD1P61803 113 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 ELOBQ15370 118 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 A0A0J9YWU9 116 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GXF2 115 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE7O76087 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 HLA-DQA1P01909 254 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 PRM2P04554 102 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE12FP0CL80 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE12GP0CL81 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE12IP0CL82 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 CAMPP49913 170 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZTI0 123 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 FAM210BQ96KR6 192 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 C18orf15Q96N68 181 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB4AO15263 64 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 SCO1O75880 301 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 MGPP08493 103 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB130BP0DP73 79 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB130AP0DP74 79 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 SSTP61278 116 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF56Q15929 161 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF575Q86XF7 245 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 H7C1H1 209 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 ATP5G1P05496 136 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 GATD1Q8NB37 220 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 FRZBQ92765 325 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-211ENST00000497210 U3KQK5 164 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms