RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.52□□□□□ -0.88
TRIOBP-211ENST00000492485 M0R2P5 195 aa9.52□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.52□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP6V0BQ99437 205 aa9.52□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 VCYO14598 125 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 ITPR1Q14643 2758 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 G3V4G9 280 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 P0DMU3 169 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM231AP0DMU4 169 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM231CP0DMU5 169 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 A4D1N5 150 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 C11orf86A6NJI1 115 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAL4O96015 105 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYGCP07315 174 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.51□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 J3QQQ9 107 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 CR1LQ2VPA4 569 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAMTS20P59510 1910 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A20O43772 301 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.5□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 A8MZ25 164 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 F8W1H4 67 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 MT-ATP8P03928 68 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 CDSNQ15517 529 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A096LPF7 62 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 OVOL1O14753 267 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8N9W7 124 aa9.49□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 PFN2P35080 140 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 PMVKQ15126 192 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 MDFICQ9P1T7 246 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 KAAG1Q9UBP8 84 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 MYCNOSP40205 109 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 GATD1Q8NB37 220 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.48□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 MAST4O15021 2626 aa9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF5Q99942 180 aa9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00158P58513 81 aa9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.47□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.46□□□□□ -0.89
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8NA96 180 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 M0R1W7 72 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.46□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A096LNJ9 63 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE12JA6NER3 117 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 EDN2P20800 178 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYBA4P53673 196 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE4Q13068 117 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE5Q13069 117 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 BAALCQ8WXS3 180 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 CLEC2BQ92478 149 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 NXPH4O95158 308 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-59P01825 116 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB130BP0DP73 79 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB130AP0DP74 79 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR9Q5T870 116 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 AJUBAQ96IF1 538 aa9.45□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2E1P51965 193 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 PAX4O43316 350 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.44□□□□□ -0.9
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.44□□□□□ -0.9
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