RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-53P01767 116 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TDRG1Q3Y452 100 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 CT83Q5H943 113 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TTC32Q5I0X7 151 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 GZMBP10144 247 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 GNRH2O43555 120 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TYMSP04818 313 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 CXCL1P09341 107 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 LINC00315P59091 139 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 KCNS1Q96KK3 526 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPQ1 181 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 A8MWL6 223 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 SPINK4O60575 86 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TCL1AP56279 114 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 DNLZQ5SXM8 178 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 Q8N1X5 172 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TSKUQ8WUA8 353 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 GTSF1Q8WW33 167 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 IL36BQ9NZH7 164 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 XKRY2A2RUG3 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 PAX4O43316 350 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SCO1O75880 301 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 IGLC6P0CF74 106 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 ASIPP42127 132 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 C18orf15Q96N68 181 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 MDFICQ9P1T7 246 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 H3BVH4 76 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SIVA1O15304 175 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 NXPH4O95158 308 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 C9orf85Q96MD7 179 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 FAM231BA6NCW3 169 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 HIGD1CA8MV81 97 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 CTRLP40313 264 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 FHL2Q14192 279 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 NUP35Q8NFH5 326 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 IMMP2LQ96T52 175 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SNAI2O43623 268 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 CRYBA4P53673 196 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 YPEL4Q96NS1 127 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 TPPP3Q9BW30 176 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 PRO0255Q9UI72 69 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 OR5AL1P0C617 328 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 ZNF415Q09FC8 603 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 S100PP25815 95 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 ZNF479Q96JC4 524 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 CNFNQ9BYD5 112 aa8.59□□□□□ -1.03
PRAME-212ENST00000485532 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 F2Z2F3 143 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 ELOBQ15370 118 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GUT8 65 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GXF2 115 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 K7EQD1 137 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 CACNG7P62955 275 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 WDR73Q6P4I2 378 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 BTF3L4Q96K17 158 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-212ENST00000485532 SPXQ9BT56 116 aa8.57□□□□□ -1.04
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