RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TAX1BP3O14907 124 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 NPSP0C0P6 89 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 SYT8Q8NBV8 401 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 PCP4P48539 62 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 CD7P09564 240 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 SMR3AQ99954 134 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 MGPP08493 103 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 H7C1H1 209 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 PTH2Q96A98 100 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 F8VRH5 84 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2V1Q13404 147 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 MUC4Q99102 2169 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 ERASQ7Z444 233 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 JMJD8Q96S16 334 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 CSTL1Q9H114 145 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 CBY3A6NI87 242 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 VCYO14598 125 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N1Y9 231 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 A6NDN8 102 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 A6NJY4 79 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 CRLF1O75462 422 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 NMUP48645 174 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 SLURP1P55000 103 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 PCP2Q8IVA1 136 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 SPRY2O43597 315 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 H3BRM9 83 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 CRYGDP07320 174 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 BAALCQ8WXS3 180 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM141Q96I45 108 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 OR11H1Q8NG94 326 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TIMM17AQ99595 171 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 MDFICQ9P1T7 246 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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PTPRF-212ENST00000477970 H3BMM0 161 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 DUX5Q96PT3 197 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 M0QY20 66 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 RHOHQ15669 191 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TAL2Q16559 108 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 ZFP2Q6ZN57 461 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZSV7 163 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 CCL25O15444 150 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DL4Q99706 377 aa9□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 IGIPA6NJ69 53 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 FHL3Q13643 280 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.99□□□□□ -0.97
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PTPRF-212ENST00000477970 PTTG1IPP53801 180 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 JPT2Q9H910 190 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.98□□□□□ -0.97
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PTPRF-212ENST00000477970 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 C16orf95Q9H693 158 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV3-20P01619 116 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRF-212ENST00000477970 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 TM2D2Q9BX73 214 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRF-212ENST00000477970 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.97□□□□□ -0.97
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