RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	IGHV3-33	P01772	117 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	SFRP2	Q96HF1	295 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	RHOD	O00212	210 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	PFDN1	O60925	122 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817		Q8N1X5	172 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	MLST8	Q9BVC4	326 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A087WWL8	130 aa		14	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817		M0R381	172 aa		14	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		14	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	BAGE2	Q86Y30	109 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817		Q9HAA7	133 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	PSCA	O43653	123 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817		Q8N3U1	123 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	CCL20	P78556	96 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A087WWC5	75 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	CXCL1	P09341	107 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	LAGE3	Q14657	143 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	XG	P55808	180 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	RAB5C	P51148	216 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	SNAI2	O43623	268 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	GCSH	P23434	173 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	C11orf52	Q96A22	123 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	DERL1	Q9BUN8	251 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	SULT1A2	P50226	295 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	RAB4B	P61018	213 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817		Q8N814	137 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	UBE2D3	P61077	147 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	UBE2D2	P62837	147 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	NIT1	Q86X76	327 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	CENPW	Q5EE01	88 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	C1QB	P02746	253 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	SST	P61278	116 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	WFDC2	Q14508	124 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	ZNF56	Q15929	161 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	SLC51B	Q86UW2	128 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	EPM2A	B3EWF7	344 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817		Q6ZNX1	250 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CTBP2-208	ENST00000476817	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	PDE6D	O43924	150 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	GZMB	P10144	247 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	FAT1	Q14517	4588 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817		A0A087WX48	190 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817		F5H697	171 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	IFNA1	P01562	189 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	GNG4	P50150	75 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	LECT2	O14960	151 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	BCL2	P10415	239 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CTBP2-208	ENST00000476817	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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