RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460981.1

REV3L-208, Transcript of REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit, human

TSL 2

Gene REV3L, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REV3L-208	ENST00000460981	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		0.34	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	PRR15L	Q9BU68	103 aa		0.34	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		0.34	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	KMT2D	O14686	5537 aa		0.33	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	PITX3	O75364	302 aa		0.33	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	COX4I1	P13073	169 aa		0.33	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	COX7B2	Q8TF08	81 aa		0.33	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	NPFF	O15130	113 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981		Q6ZUT4	128 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	PLXNA2	O75051	1894 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		0.32	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	UBE2G1	P62253	170 aa		0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	C10orf82	Q8WW14	230 aa		0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		0.31	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	NCR2	O95944	276 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	IL5	P05113	134 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SMCO1	Q147U7	214 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981		Q96NJ1	140 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981		V9GYV3	84 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		0.3	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	MED13L	Q71F56	2210 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981		A6NIN4	97 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	COPZ1	P61923	177 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	RPRM	Q9NS64	109 aa		0.29	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	ACYP2	P14621	99 aa		0.28	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		0.28	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		0.28	□□□□□ -2.36
REV3L-208	ENST00000460981	SOGA1	O94964	1423 aa		0.28	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	KDM6B	O15054	1643 aa		0.27	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	CEP152	O94986	1710 aa		0.27	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	JMJD1C	Q15652	2540 aa		0.27	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		0.27	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.27	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	F5	P12259	2224 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	SNCG	O76070	127 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	APOD	P05090	189 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	NMB	P08949	121 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	SPTSSA	Q969W0	71 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	EDDM3B	P56851	147 aa		0.25	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		0.25	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	SDF2	Q99470	211 aa		0.25	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	PFDN5	Q99471	154 aa		0.25	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	UBE2D1	P51668	147 aa		0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	COX6A2	Q02221	97 aa		0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981		Q6ZRX8	168 aa		0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		0.23	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	ADGRB1	O14514	1584 aa		0.23	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		0.23	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.23	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		0.23	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	NDUFB6	O95139	128 aa		0.23	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		0.22	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	IFNA17	P01571	189 aa		0.22	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	CBLN1	P23435	193 aa		0.22	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	GCHFR	P30047	84 aa		0.22	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		0.22	□□□□□ -2.37
REV3L-208	ENST00000460981	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	SPINK1	P00995	79 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	DPH3	Q96FX2	82 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	SEC11C	Q9BY50	192 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	MYH6	P13533	1939 aa		0.21	□□□□□ -2.38
REV3L-208	ENST00000460981	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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