RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 M0R2N4 97 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 BIN3Q9NQY0 253 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 NAT8Q9UHE5 227 aa7.6□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BNG1 76 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00315P59091 139 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.59□□□□□ -1.19
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RPRD1B-202ENST00000449186 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 V9GYV3 84 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-202ENST00000449186 ADCYAP1P18509 176 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 EVI2AP22794 236 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 CTRLP40313 264 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 COMMD7Q86VX2 200 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 OSTCQ9NRP0 149 aa7.58□□□□□ -1.2
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RPRD1B-202ENST00000449186 SRIP30626 198 aa7.57□□□□□ -1.2
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RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE5Q13069 117 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 SLAQ13239 276 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE13Q4V321 117 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.57□□□□□ -1.2
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RPRD1B-202ENST00000449186 XKRY2A2RUG3 117 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 MGPP08493 103 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 CCL18P55774 89 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF56Q15929 161 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF212Q495C1 297 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1W2PPQ1 181 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 HIGD1CA8MV81 97 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 A8MWL6 223 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 F2Z2F3 143 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 F5H697 171 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 RHODO00212 210 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00694P0DN24 101 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 CACNG7P62955 275 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 RHOHQ15669 191 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 TWIST1Q15672 202 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 TSKUQ8WUA8 353 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.55□□□□□ -1.2
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RPRD1B-202ENST00000449186 CT83Q5H943 113 aa7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.54□□□□□ -1.2
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RPRD1B-202ENST00000449186 AP1S3Q96PC3 154 aa7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 CNFNQ9BYD5 112 aa7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM218A2RU14 115 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 CIDEAO60543 219 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 GAS8-AS1O95177 125 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 RAB4BP61018 213 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZR54 194 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N3U1 123 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 Q9H8V8 135 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM17P0DL12 118 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR73Q6P4I2 378 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 UQCC3Q6UW78 93 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 F8W036 122 aa7.51□□□□□ -1.21
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RPRD1B-202ENST00000449186 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.51□□□□□ -1.21
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RPRD1B-202ENST00000449186 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GUT8 65 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 TRGC1P0CF51 173 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 UBE2D3P61077 147 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 UBE2D2P62837 147 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 GATD1Q8NB37 220 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 SIVA1O15304 175 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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