RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RETNQ9HD89 108 aa14.71□□□□□ -0.05
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.7□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.7□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.69□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIT1Q86X76 327 aa14.68□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 B9D2Q9BPU9 175 aa14.66□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NACAE9PAV3 2078 aa14.65□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFRSF6BO95407 300 aa14.65□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17DQ8TAD2 202 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF183Q96D59 192 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.65□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.64□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRACQ8N912 160 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.64□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.63□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMTP48728 403 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRN3P1Q2M238 152 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FA2HQ7L5A8 372 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR11H2Q8NH07 326 aa14.61□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA25Q9BR10 227 aa14.61□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRSS47A8MTI9 375 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R17O96001 155 aa14.6□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 F5H697 171 aa14.59□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMAT4Q9H898 229 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RS1O15537 224 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TGP01266 2768 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.55□□□□□ -0.08
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.55□□□□□ -0.08
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