RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 MED14OSP0DP75 135 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 DEFB131AP59861 70 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 UBE2V1Q13404 147 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 RAB37Q96AX2 223 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 ZMAT4Q9H898 229 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 K7EP13 123 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 C20orf78Q9BR46 151 aa11.09□□□□□ -0.63
USP10-201ENST00000219473 LINC00315P59091 139 aa11.08□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 ZNF56Q15929 161 aa11.08□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.08□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 A0A087WX48 190 aa11.08□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.08□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 A0A1W2PRX2 142 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 K7EMI3 77 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 GCSHP23434 173 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 EMP1P54849 157 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 NACAE9PAV3 2078 aa11.07□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 LGALS9O00182 355 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 TOMM6Q96B49 74 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 FOSL1P15407 271 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 HSD52Q0P140 79 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.06□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.05□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 ZNF876PQ49A33 203 aa11.05□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 LINC01619G3V211 115 aa11.05□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 NXPH4O95158 308 aa11.05□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.05□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 H7C1H1 209 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 SEC11AP67812 179 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 F8VRH5 84 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 BAALCQ8WXS3 180 aa11.04□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 C9orf85Q96MD7 179 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 AKAP9Q99996 3911 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 A6NDN8 102 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 H3BUT2 72 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 PPP1R17O96001 155 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 PLNP26678 52 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 AMTNQ6UX39 209 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 SYT8Q8NBV8 401 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 KIR2DL4Q99706 377 aa11.03□□□□□ -0.64
USP10-201ENST00000219473 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 SIVA1O15304 175 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 FXYD2P54710 66 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 RNF152Q8N8N0 203 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 ODF3Q96PU9 254 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 CYSLTR1Q9Y271 337 aa11.02□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 Q6ZSV7 163 aa11.01□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 CRYGDP07320 174 aa11.01□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 HLA-DRB4P13762 266 aa11.01□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.01□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 K7ERJ3 54 aa11.01□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 VCYO14598 125 aa11□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 PEMTQ9UBM1 199 aa11□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 OR11H12B2RN74 326 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 H3BMM0 161 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 P0DMU3 169 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 FAM231AP0DMU4 169 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 FAM231CP0DMU5 169 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 PROK1P58294 105 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 Q8N2B8 174 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.99□□□□□ -0.65
USP10-201ENST00000219473 OR11H2Q8NH07 326 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162.9 ms