RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	S100A1	P23297	94 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	CSN1S1	P47710	185 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468		Q5VSD8	79 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V1G1	O75348	118 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	GYPE	P15421	78 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	EVI2A	P22794	236 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TIRAP	P58753	221 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2G2	P60604	165 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	MED9	Q9NWA0	146 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	MYCBP2	O75592	4640 aa		9.38	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468		C9JCJ5	164 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	PAGE4	O60829	102 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	FRZB	Q92765	325 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	SGK494	Q96LW2	274 aa		9.37	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GV50	99 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	CRYGD	P07320	174 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	GCSH	P23434	173 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		9.36	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00862	A6NCI5	91 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468		M0R2P5	195 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	PEX7	O00628	323 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	FAM210A	Q96ND0	272 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	PSG8	Q9UQ74	426 aa		9.35	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		9.34	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	CRIP1	P50238	77 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf52	Q96A22	123 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	NAGK	Q9UJ70	344 aa		9.33	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	GNRH2	O43555	120 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TYMS	P04818	313 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468		Q86TA4	180 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	MLST8	Q9BVC4	326 aa		9.32	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468		F6UZH7	168 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	CST9LP1	Q5W188	147 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TREM1	Q9NP99	234 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	GNG13	Q9P2W3	67 aa		9.31	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	LTA	P01374	205 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	PPT1	P50897	306 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	PRNT	Q86SH4	94 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	KCNS1	Q96KK3	526 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	CIDEA	O60543	219 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV2-8	P01709	118 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	BCL2	P10415	239 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	BLOC1S1	P78537	153 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	HAMP	P81172	84 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N814	137 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	DERL1	Q9BUN8	251 aa		9.29	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	FAM229A	H3BQW9	127 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	PSCA	O43653	123 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468	UQCC3	Q6UW78	93 aa		9.28	□□□□□ -0.92
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZSN1	163 aa		9.28	□□□□□ -0.92

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