RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM189A5PLL7 270 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR9Q5T870 116 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNS1Q96KK3 526 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC01587Q99440 93 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 H7BYZ3 331 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TNP2Q05952 138 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 KIR3DS1Q14943 382 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF212Q495C1 297 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZR54 194 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT11Q96G61 164 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 CBY3A6NI87 242 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MWL6 223 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 HTN1P15515 57 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 CRIP1P50238 77 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC21Q5SSG8 566 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 MDFICQ9P1T7 246 aa8.28□□□□□ -1.08
CAPNS1-209ENST00000590049 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRY2O43597 315 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC01559Q495D7 138 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CT83Q5H943 113 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 MUC2Q02817 5179 aa8.27□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087WWC5 75 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 S100PP25815 95 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ASIPP42127 132 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZWC4 215 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 BORCS7Q96B45 105 aa8.26□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 P0DMU3 169 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM231AP0DMU4 169 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM231CP0DMU5 169 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 RRN3P1Q2M238 152 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB135Q30KP9 77 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TSKUQ8WUA8 353 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TPPP3Q9BW30 176 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 V9GYV3 84 aa8.25□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 LRP2P98164 4655 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PPQ1 181 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TYMSP04818 313 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CXCL1P09341 107 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF415Q09FC8 603 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TDRG1Q3Y452 100 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZQT7 251 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 IL36BQ9NZH7 164 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM231BA6NCW3 169 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SNURFLB1AK76 121 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 C16orf74Q96GX8 76 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 IMMP2LQ96T52 175 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.23□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 HIGD1CA8MV81 97 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 F2Z2F3 143 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BVH4 76 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 GNRH2O43555 120 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 GZMBP10144 247 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TCL1AP56279 114 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 OR11H2Q8NH07 326 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 BTF3L4Q96K17 158 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 NEU1Q99519 415 aa8.22□□□□□ -1.09
CAPNS1-209ENST00000590049 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.22□□□□□ -1.09
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