RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 NTF3P20783 257 aa22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB4BP61018 213 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXN1Q5VSR9 72 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf196B1AJZ1 125 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TWIST1Q15672 202 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF493Q6ZR52 646 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10AG1Q8NH19 301 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2CO00762 179 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGC2P03986 189 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF415Q09FC8 603 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MDFICQ9P1T7 246 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 NXPH4O95158 308 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 HTN1P15515 57 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP82Q8N141 532 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FRZBQ92765 325 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 FABP9Q0Z7S8 132 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM191AQ9H0A3 160 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC21A0A140T8X8 626 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB5BP61020 215 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM15Q7Z3B0 74 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT8Q8NBV8 401 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SPXQ9BT56 116 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PHOX2AO14813 284 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGC1P0CF51 173 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf72Q8NBR9 251 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 PTH2Q96A98 100 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R381 172 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 APCSP02743 223 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SSTP61278 116 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf74Q96GX8 76 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MSRB1Q9NZV6 116 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM9A6NGZ8 99 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RRN3P1Q2M238 152 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DMRTA1Q5VZB9 504 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFAF3Q9BU61 184 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SLAQ13239 276 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZWC4 215 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 AP1S3Q96PC3 154 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RCHY1Q96PM5 261 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R2P5 195 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM104BQ5XKR9 115 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 AZU1P20160 251 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17DQ8TAD2 202 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PRM2P04554 102 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF876PQ49A33 203 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 EVI2AP22794 236 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DPH3P1Q9H4G8 78 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRY2O43597 315 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB135Q30KP9 77 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BKO60814 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BJP06899 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BOP23527 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BBP33778 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BDP58876 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BCP62807 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H2BEQ16778 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 AMN1Q8IY45 258 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BHQ93079 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF183Q96D59 192 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BNQ99877 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2BMQ99879 126 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM17P0DL12 118 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS9BQ3B8N2 356 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 X6R8D5 127 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RASL10AQ92737 203 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB4AP20338 218 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1644Q3SXP7 199 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 NACAE9PAV3 2078 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAH3Q8TD57 4116 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MWV9 139 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PPBPP02775 128 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF185Q96GF1 192 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 OVOL2Q9BRP0 275 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PLAC8L1A1L4L8 177 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAM2Q2M2H8 2515 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MIFP14174 115 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SRIP30626 198 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11H2Q8NH07 326 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ORMDL3Q8N138 153 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 POM121L12Q8N7R1 296 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-206ENST00000588815 U3KQK5 164 aa22.31■■□□□ 1.16
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