RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 RBAKDNA6NC62 111 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 SAP30O75446 220 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS1P07477 247 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 MDFICQ9P1T7 246 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 CBY3A6NI87 242 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 LY6G6DO95868 133 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 XCL2Q9UBD3 114 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 OR4C46A6NHA9 309 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 K7EMT4 169 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 CCL24O00175 119 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 SOCS3O14543 225 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 IGLC6P0CF74 106 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 RNF151Q2KHN1 245 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01006Q8NI28 216 aa8.8□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 LEPP41159 167 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 LINC01559Q495D7 138 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.79□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 ZNF575Q86XF7 245 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 MAST4O15021 2626 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 DLEU1O43261 78 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 RAX2Q96IS3 184 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 K7EQG2 157 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 ATP6V0BQ99437 205 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.78□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 CD5LO43866 347 aa8.77□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 CDKN1BP46527 198 aa8.77□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.77□□□□□ -1
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
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PTPRK-216ENST00000524481 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 ZNF56Q15929 161 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 KLK9Q2XQG4 91 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 C20orf202A1L168 122 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 C7orf71A4D174 169 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 RNF185Q96GF1 192 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 ESDP10768 282 aa8.76□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 MUC4Q99102 2169 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 STAB1Q9NY15 2570 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 PF4P02776 101 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 EMP1P54849 157 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 PTTG1IPP53801 180 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 RIPPLY3P57055 190 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 DNLZQ5SXM8 178 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 AP1S3Q96PC3 154 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM160Q9NX00 188 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 BRI3O95415 125 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 Q6ZVH6 145 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF747Q9BV97 191 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.72□□□□□ -1.01
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