RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.56□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 AKR1D1P51857 326 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 STHQ8IWL8 128 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 ORMDL3Q8N138 153 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 NAGKQ9UJ70 344 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 U3KQK5 164 aa5.55□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 ATRQ13535 2644 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 KNCNA6PVL3 124 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 J3KRW8 73 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 NXPH4O95158 308 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SMIM6P0DI80 62 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 PMCHP20382 165 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.54□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 CUBNO60494 3623 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 H3BVH4 76 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 M0R2Z0 102 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 GNRH2O43555 120 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SERF1AO75920 110 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 PPP1R17O96001 155 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 INSP01308 110 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV3-20P01619 116 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 CD7P09564 240 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 FABP4P15090 132 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 RAB4AP20338 218 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 CKS2P33552 79 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 KIR3DS1Q14943 382 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 MUC21Q5SSG8 566 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 SYT8Q8NBV8 401 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 PTH2Q96A98 100 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF747Q9BV97 191 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 JMJD1CQ15652 2540 aa5.53□□□□□ -1.52
SEC31A-241ENST00000515749 MUC4Q99102 2169 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 IFITM10A6NMD0 228 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 PRSS47A8MTI9 375 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00614P0C842 121 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 Q6ZQT7 251 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 NIT1Q86X76 327 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 AMN1Q8IY45 258 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 Q8N1Y9 231 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 DEFB125Q8N687 156 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 MRAP2Q96G30 205 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 C9orf85Q96MD7 179 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 PRELID3AQ96N28 172 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 AP1S3Q96PC3 154 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.52□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 CBY3A6NI87 242 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 D6R8Y8 96 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 HSBP1O75506 76 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 SMIM17P0DL12 118 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RNF185Q96GF1 192 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 SPXQ9BT56 116 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms