RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1B0GUT8	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	LY6G6C	O95867	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	CRISP2	P16562	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SLA	Q13239	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RIG	Q13278	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		A0A0J9YX75	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		A0A1B0GW15	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	S100A8	P05109	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	GPX1	P07203	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	CTRL	P40313	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	LEP	P41159	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183		Q6ZQT7	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	S100A2	P29034	98 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SRI	P30626	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	DEFB131A	P59861	70 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SST	P61278	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	KLLN	B2CW77	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183		F2Z2F3	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	FABP4	P15090	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183		Q0VG73	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TWIST1	Q15672	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	XP32	Q5T750	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	C7orf71	A4D174	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183		M0R2Z0	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	NUPR1	O60356	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	SERF1A	O75920	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	AMBP	P02760	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TSPO	P30536	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	ASIP	P42127	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00310	P59036	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183		H3BMM0	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183		H3BVH4	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	SNAI2	O43623	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	NTF3	P20783	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	TCTA	P57738	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF124	Q15973	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-231	ENST00000514183	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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