RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.82■□□□□ 0.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RHOHQ15669 191 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.81■□□□□ 0.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIRAPP58753 221 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q86TA4 180 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa15.81■□□□□ 0.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 STOML3Q8TAV4 291 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP1BQ9NZR2 4599 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.78■□□□□ 0.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.77■□□□□ 0.12
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FHITP49789 147 aa15.76■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.76■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.75■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH2D1AO60880 128 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF345Q14585 488 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.74■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JPT2Q9H910 190 aa15.72■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.71■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAGE13Q4V321 117 aa15.71■□□□□ 0.11
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.7■□□□□ 0.1
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RHODO00212 210 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL2L11O43521 198 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PFDN1O60925 122 aa15.66■□□□□ 0.1
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC01559Q495D7 138 aa15.66■□□□□ 0.1
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