RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.49□□□□□ -0.41
TOM1-216ENST00000492723 PEMTQ9UBM1 199 aa12.49□□□□□ -0.41
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TOM1-216ENST00000492723 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TOM1-216ENST00000492723 C7orf71A4D174 169 aa12.48□□□□□ -0.41
TOM1-216ENST00000492723 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TOM1-216ENST00000492723 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.48□□□□□ -0.41
TOM1-216ENST00000492723 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.48□□□□□ -0.41
TOM1-216ENST00000492723 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
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TOM1-216ENST00000492723 SORL1Q92673 2214 aa12.48□□□□□ -0.41
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TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PRX2 142 aa12.45□□□□□ -0.42
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TOM1-216ENST00000492723 Q8N8P6 123 aa12.43□□□□□ -0.42
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TOM1-216ENST00000492723 LINC01546A6NGU7 62 aa12.43□□□□□ -0.42
TOM1-216ENST00000492723 KNCNA6PVL3 124 aa12.43□□□□□ -0.42
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TOM1-216ENST00000492723 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.41□□□□□ -0.42
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TOM1-216ENST00000492723 C18orf15Q96N68 181 aa12.4□□□□□ -0.42
TOM1-216ENST00000492723 SMR3AQ99954 134 aa12.4□□□□□ -0.42
TOM1-216ENST00000492723 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.4□□□□□ -0.42
TOM1-216ENST00000492723 LINC01006Q8NI28 216 aa12.4□□□□□ -0.42
TOM1-216ENST00000492723 TRAV2A0A0B4J234 112 aa12.39□□□□□ -0.43
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TOM1-216ENST00000492723 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 Q8N1Y9 231 aa12.39□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 DEFB125Q8N687 156 aa12.39□□□□□ -0.43
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TOM1-216ENST00000492723 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.38□□□□□ -0.43
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TOM1-216ENST00000492723 FHL3Q13643 280 aa12.37□□□□□ -0.43
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TOM1-216ENST00000492723 C16orf95Q9H693 158 aa12.37□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.37□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 C9orf85Q96MD7 179 aa12.37□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.37□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.37□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 WNK1Q9H4A3 2382 aa12.37□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 LGALS9CQ6DKI2 356 aa12.36□□□□□ -0.43
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