RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 F8W735 103 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
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NISCH-212ENST00000488380 SNCGO76070 127 aa10.32□□□□□ -0.76
NISCH-212ENST00000488380 TTC32Q5I0X7 151 aa10.32□□□□□ -0.76
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NISCH-212ENST00000488380 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.32□□□□□ -0.76
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NISCH-212ENST00000488380 HERV-K104P63124 156 aa10.29□□□□□ -0.76
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NISCH-212ENST00000488380 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
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NISCH-212ENST00000488380 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.25□□□□□ -0.77
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NISCH-212ENST00000488380 C11orf86A6NJI1 115 aa10.25□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 RHODO00212 210 aa10.25□□□□□ -0.77
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NISCH-212ENST00000488380 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 A4D1N5 150 aa10.22□□□□□ -0.77
NISCH-212ENST00000488380 G3V318 75 aa10.22□□□□□ -0.77
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