RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 OR5AL1P0C617 328 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 TCL1AP56279 114 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 CXorf65A6NEN9 183 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 GNRH2O43555 120 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 SNAI2O43623 268 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 IGLC6P0CF74 106 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 HTN1P15515 57 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZQT7 251 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 BTF3L4Q96K17 158 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 C9orf85Q96MD7 179 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 LYRM9A8MSI8 78 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 S100PP25815 95 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 CACNG7P62955 275 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 ZNF575Q86XF7 245 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 Q8NAQ8 132 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 SYT8Q8NBV8 401 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 IL17DQ8TAD2 202 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 BORCS7Q96B45 105 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 M0R2P5 195 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 CIDEAO60543 219 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 AZU1P20160 251 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 CTRLP40313 264 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 CNFNQ9BYD5 112 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 MDFICQ9P1T7 246 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GW15 77 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 HIGD1CA8MV81 97 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V1G1O75348 118 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 ZFP82Q8N141 532 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GUT8 65 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 H3BVH4 76 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 SPINK4O60575 86 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 NXPH4O95158 308 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 S100A8P05109 93 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 GTSF1Q8WW33 167 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 RASL10AQ92737 203 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 C18orf15Q96N68 181 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 GZMBP10144 247 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 RIGQ13278 110 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 RASL11AQ6T310 242 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 NUP35Q8NFH5 326 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 RETNQ9HD89 108 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 HERC2O95714 4834 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 A8MWV9 139 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 TRGC1P0CF51 173 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 ZNF876PQ49A33 203 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 COX19Q49B96 90 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 TPPP3Q9BW30 176 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 DKK2Q9UBU2 259 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 PRM2P04554 102 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 NTF3P20783 257 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 FRZBQ92765 325 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 AP1S3Q96PC3 154 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 M0R381 172 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 RHODO00212 210 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 EMP1P54849 157 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 DAD1P61803 113 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 HBBP68871 147 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 TWIST1Q15672 202 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-211ENST00000488243 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms