RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 HOXA5P20719 270 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 LEPP41159 167 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 CCL18P55774 89 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 OR5I1Q13606 314 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ADIRFQ15847 76 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GAGE12BA1L429 117 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 C16orf90A8MZG2 172 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GAGE7O76087 117 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GCGP01275 180 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GAGE12FP0CL80 117 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GAGE12GP0CL81 117 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GAGE12IP0CL82 117 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 SMUG1Q53HV7 270 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 APOC3P02656 99 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GPX1P07203 203 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 CRIP1P50238 77 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 BTN1A1Q13410 526 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 PRR27Q6MZM9 219 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZQT7 251 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 ISOC2Q96AB3 205 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 Q9H8V8 135 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 C7orf71A4D174 169 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 SH2D1AO60880 128 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 Q6AWC8 147 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 M0R036 132 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 ESRGQ1W209 222 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZTI0 123 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 BIN3Q9NQY0 253 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 SNURFLB1AK76 121 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 SVBPQ8N300 66 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 NUDT11Q96G61 164 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 S100A1P23297 94 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 SFRP2Q96HF1 295 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-212ENST00000485532 OSTCQ9NRP0 149 aa8.72□□□□□ -1.01
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PRAME-212ENST00000485532 B4DEV8 164 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 CDK2AP2O75956 126 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 SNAPINO95295 136 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 P01737 135 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-2P60368 255 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 ERVFC1-1P60608 527 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 V9GYV3 84 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 RHEBQ15382 184 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 LINC01559Q495D7 138 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 MUC21Q5SSG8 566 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 A0A096LPF7 62 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 ORM1P02763 201 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 MT-ND4LP03901 98 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 UPK3BQ9BT76 320 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 NAGKQ9UJ70 344 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WWC5 75 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 H3BNG1 76 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R2P9O14990 202 aa8.68□□□□□ -1.02
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