RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS9CQ6DKI2 356 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCKAP5O14513 1909 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF747Q9BV97 191 aa12.96□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.96□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ODF3L1Q8IXM7 274 aa12.96□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRIP3Q6Q6R5 217 aa12.96□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.96□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 I3L3M4 83 aa12.95□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCP2Q8IVA1 136 aa12.94□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.93□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N9W7 124 aa12.93□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A096LPF7 62 aa12.92□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAC2D3DTV9 90 aa12.92□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AJUBAQ96IF1 538 aa12.92□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.92□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N7P7 452 aa12.92□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF12Q9Y4X4 402 aa12.92□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F5H768 121 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTSF1Q8WW33 167 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8NA96 180 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BUB3O43684 328 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-23P01705 113 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE6Q13070 117 aa12.91□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.91□□□□□ -0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.91□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LEPROTO15243 131 aa12.9□□□□□ -0.34
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf118A6NHY6 69 aa12.9□□□□□ -0.35
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BMG7 143 aa12.88□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SS18Q15532 418 aa12.88□□□□□ -0.35
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 J3QLI3 93 aa12.87□□□□□ -0.35
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.87□□□□□ -0.35
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGF6P10767 208 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C20orf78Q9BR46 151 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EP13 123 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAD1P61803 113 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P0C879 139 aa12.85□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM243Q9BU79 118 aa12.85□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CGB3P0DN86 165 aa12.85□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CGB7P0DN87 165 aa12.85□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF503Q96F45 646 aa12.85□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EMI3 77 aa12.85□□□□□ -0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
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