RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM86BQ8N661 226 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 F6UB75 175 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 CD5LO43866 347 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 HLA-DRB4P13762 266 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 CFAP161Q6P656 301 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 AP1S3Q96PC3 154 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 ITPR3Q14573 2671 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 ODF1Q14990 250 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 A0A0J9YX75 114 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 EDN2P20800 178 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM160Q9NX00 188 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SPG11Q96JI7 2443 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C7orf71A4D174 169 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 RASL10AQ92737 203 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB1P60022 68 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 COX11Q9Y6N1 276 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 HIVEP1P15822 2718 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WW49 117 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SMIM17P0DL12 118 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TFPI2P48307 235 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 FXYD7P58549 80 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 NOTCH2Q04721 2471 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 AKAP6Q13023 2319 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01549A6NIU2 74 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 A8MTW9 85 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 RIPPLY3P57055 190 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 MPV17L2Q567V2 206 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C9orf85Q96MD7 179 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 CREBBPQ92793 2442 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRF-212ENST00000477970 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
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PTPRF-212ENST00000477970 LY6G6DO95868 133 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TOMM6Q96B49 74 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 J3KRW8 73 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 G0S2P27469 103 aa9.1□□□□□ -0.95
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PTPRF-212ENST00000477970 NUDT3O95989 172 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 IGKCP01834 107 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SRD5A1P18405 259 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SYNJ2BPP57105 145 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WX48 190 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 DPM2O94777 84 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 SEC11AP67812 179 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 C18orf15Q96N68 181 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRF-212ENST00000477970 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRF-212ENST00000477970 PRSS1P07477 247 aa9.08□□□□□ -0.96
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PTPRF-212ENST00000477970 F8P00451 2351 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 PLNP26678 52 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01619G3V211 115 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 HSD52Q0P140 79 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 PEMTQ9UBM1 199 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRF-212ENST00000477970 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
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